微生物是结构简单、形态微小、分布广泛的生物的总称，以微生物为主的产品称为微生态制剂，常见的水产微生态制剂有着共同的特点：

1、微生物的营养：微生物的生长、繁殖的主要营养物质有氮源和碳源，其中氮源有铵态氮、亚硝酸氮、硝酸态氮等无机态氮及氨基酸、蛋白质等有机态氮，常见微生物利用速度最快的是铵态氮。典型碳源有碳酸盐等无机碳及葡萄糖、淀粉、纤维素、有机酸等有机碳，其中葡萄糖是常见微生物利用最高的碳源。

2、微生态制剂的作用途径：微生态制剂通过其不断生长和繁殖来实现改水的作用，即微生态制剂通过定植和增殖作用而起到改水的功能。单个的微生物细胞对水体环境的影响是有限的。在生长条件适宜、有可利用的营养物质，微生物不断的繁殖，细菌数量不断增加，对水质才有根本改变。微生态制剂改水（或底）就是通过分解和利用水体中的各类物质以达到其作用。

对虾养殖池塘长期投放饲料，有满足微生物生长所需的营养，长期直接泼洒微生态制剂，效果明显；淡水养殖池塘特别是以投喂大麦、草类为主及淹青池的池塘，以纤维素为主的碳源丰富，而缺乏氮源，单独投放微生态制剂效果不明显，但是微生态制剂和肥料（碳铵等）一起使用满足了微生物氮源的需求，肥水、改水一举多得。

3、微生态制剂的改水功能：微生态制剂能降解水体中的氨氮、亚硝酸氮等水体中的有害物质的含量。氨氮和亚硝酸氮都能降低水产动物血液载氧能力，导致生物缺氧，严重时窒息死亡。但是氨氮和亚硝酸氮都是常见微生物生长繁殖可吸收和利用的氮源，通过微生态制剂的吸收利用，从而降低水体中氨氮、亚硝酸氮含量消除水体有害物质。

微生态制剂降解氨氮、亚硝酸氮与化学螯合剂、吸附剂原理和作用不同，微生物的降解是不可逆的彻底降解，而化学的降解随天气变化易反弹。